Новая модификация, Legacy 650, выпускается параллельно с Legacy 600, но именно на более свежий самолет следует обратить внимание в связи с возросшей дальностью полета, улучшенной звукоизоляцией салона и новыми вариантами и материалами отделки интерьера
Legacy 650 получил сертификат HALTO (High Altitude Landing and Takeoff Operation), что дает право совершать взлет и посадку в сложных условиях высокогорья. Лицом бренда и обладателем Legacy 650 в 2012 году стал известный китайский актер Джеки Чан.
На борту самолёта Embraer Legacy 650 может разместиться до 14 пассажиров (при полной загрузке), однако, в большинстве случаев, эти воздушные суда комплектуются 8-10 пассажирскими местами. Большое количество свободного пространства позволяет совершать удобные авиаперелёты даже на протяжённых маршрутах, что и является одним из факторов того, почему текущая модель пользуется большим спросом.
Просторный пассажирский салон лайнера разделен на три зоны, включающие отдельный изолированный кабинет. На борту есть современно оборудованный кухонный блок, а в качестве дополнительной опции есть возможность установки второго туалета.
Среди преимуществ Legacy 650 и багажный отсек объемом 8,1 м3, который доступен во время полета и подходит для перевозки крупногабаритных грузов.